La Escuela Secundaria "Emiliano Zapata" # 13, pertenece al subsistema SEIEM, Secundarias Generales. El turno matutino es de 7:00 a.m. a 1:10 p.m. y el vespertino de 10:40 a.m. a 4:50 p.m (horario cruzado). El Director es Armando Estrada Sánchez. Supervisor de zona Profr. Antonio Flores Osorno. El total de alumnos es de 912 y cuenta con 39 docentes. Ubicada en Av. Ejidal S/N Col. Emiliano Zapata. Ayotla, Ixtapaluca Estado de México.
En la década de los 60s empieza la inquietud de la comunidad de construir una Escuela Secundaria, en esa época no había ninguna en el municipio, la única era la "7 de Enero". En ese tiempo la directiva estaba precedida por los señores: Miguel Fragoso, José Buendía, Ernesto Valdez, José Velázquez y Cayetano Bueno, no se dan porvencidos y solicitan ayuda al CAPFCE, el cual estuvo de acuerdo en proporcionar el material para su construcción en aproximadamente un año y medio.
La Escuela está construida por tres hectáreas de terreno, una donada por la parcela escolar de la Escuela Primaria "Rafael Ramírez", la segunda de los ejidos del pueblo y la otra donada por el señor Cayetano Bueno.
LA Escuela es inagurada el 7 de Enero de 1968, por tres integrantes del "Escuadrón 201", que participaron heróicamente en la Segunda Guerra Mundial y por la parte oficial el Sr. Solares de la SEP.
El primer Director de la Secundaria "Emiliano Zapata" fue el Profr. Francisco Peñaloza, empieza a trabajar con tres grupos de primer año, más los alumnos que venían de segundo y tercer grado, que provenían de la Secundaria "7 de Enero".
Actualmente la Escuela cuenta con 42 años de prestar servicio a la comunidad de Ayotla y pueblos circunvecinos como son: Tlalpizáhuac, Tlapacoya, Valle de Chalco, entre otros.
